1. Руководство и советы, Вступление
2. Босс: Доктор Нефариус (Введение)
3. Корсон V: Призрак в Гнусном городе
4. Босс: Гнусный Молох
5. Корсон V: Зараженная консоль №1
6. Планета Саргассо: Логово Ривета, Аномалия первого измерения
7. Босс: Искатель Ног
8. Корсон V: Шпионский бот на фабрике (дополнительная миссия)
9. Место завалов Скарсту: Арена в баре "Зурки"
10. Саргассо: отделочные камни Труди (дополнительное задание)
11. Савали: Архив измерений, вторая зараженная консоль
12. Босс: Командиры вторжения
13. Измерительная станция в шахте
14. Босс: Неуместный джаггернаут
15. Вторая аномалия и бурение
16. Торрен IV: Путь к Мерцанию
17. Босс: Крошка Роджер и не такой уж крошка Роджер
18. Планета Корделион: станция Кедаро, третья зараженная консоль
19. Босс: Элитное охранное командование
20. Босс: Доктор Нефариус (Скарсту - Поле крушения)
21. Скарсту - Поле обломков: серебро на арене
22. Планета Ардолис: пиратская база, четвертая зараженная консоль
23. Босс: Крабов МакГи
24. Побег капитана Кванта и битва с пиратами
25. Воздушный бой на Саргассо, третья аномалия
26. Планета Савали - Карта измерений, пятая зараженная консоль, четвертая аномалия
27. Планета Вицерон: тюрьма Зордум
28. Босс: Эскорт королевской гвардии
29. Скарсту - Поле обломков: Золотой кубок
30. Меганополис: Последняя битва

1. Все боты-шпионы и R.I.D.A. 8 - Супер-оружие
2. Все КрейггерБеарс

Рэтчет, Кит, Кланк и Ривет договариваются о встрече в баре на поле обломков Скарсту, где они впервые встречаются вчетвером. Кланк присоединяется к Рэтчету, а Кит с тех пор ходит с Риветом.

К сожалению, они попадают в засаду, устроенную доктором Нефариусом. Ривету удается освободиться, но при этом он переносит борьбу с гадом на арену.

Доктор Нефариус в этой версии не особенно быстр, но он использует тактику, которую будет оттачивать в последующих встречах. Поэтому запомните его манеру поведения. Особенно его быстрые падающие атаки, от которых можно уклониться с помощью призрачного спринта. А пока разогрейте его с помощью ускорителя Негатрона.

Тем временем Nefarious отправляет вас через пространственный портал на трассу. Избегайте препятствий. В конце рельса Клепа разбивается, но перед самым ударом в руки попадает крюк. Используйте его с помощью кнопки L1, чтобы броситься на другую арену.

Здесь есть боеприпасы, но нет исцеления, поэтому не стоит действовать неосторожно. Примерно на середине боя Нефариус перебрасывает вас в другое измерение к Грунтору. Теперь вам предстоит сразиться с двумя крупными врагами, сосредоточьтесь сначала на Грунторе, так вы быстрее с ним расправитесь.

Доктор Нефариус постоянно меняет оружие, но какие бы снаряды он ни посылал, от них можно легко уйти, если продолжать двигаться. Чтобы быстро закончить бой, используйте "Бурильную собаку" в сочетании с ускорителем Негатрона. Но не радуйтесь слишком рано!

Ваша победа над Доктором Нефариусом омрачена появлением Императора Нефариуса. Он - настоящий правитель этого измерения, и его легко отличить. Его голос не такой пронзительный, стеклянный купол на голове красный, а не зеленый, и в целом он просто злее, чем немного придурковатый Доктор. Он объявляет о начале большой битвы на родной планете Ривета. Но прежде чем отправиться туда, вам понадобится много ресурсов и поддержка капитана Кванта. По одной штуке за раз!