1. Руководство и советы, Вступление
2. Босс: Доктор Нефариус (Введение)
3. Корсон V: Призрак в Гнусном городе
4. Босс: Гнусный Молох
5. Корсон V: Зараженная консоль №1
6. Планета Саргассо: Логово Ривета, Аномалия первого измерения
7. Босс: Искатель Ног
8. Корсон V: Шпионский бот на фабрике (дополнительная миссия)
9. Место завалов Скарсту: Арена в баре "Зурки"
10. Саргассо: отделочные камни Труди (дополнительное задание)
11. Савали: Архив измерений, вторая зараженная консоль
12. Босс: Командиры вторжения
13. Измерительная станция в шахте
14. Босс: Неуместный джаггернаут
15. Вторая аномалия и бурение
16. Торрен IV: Путь к Мерцанию
17. Босс: Крошка Роджер и не такой уж крошка Роджер
18. Планета Корделион: станция Кедаро, третья зараженная консоль
19. Босс: Элитное охранное командование
20. Босс: Доктор Нефариус (Скарсту - Поле крушения)
21. Скарсту - Поле обломков: серебро на арене
22. Планета Ардолис: пиратская база, четвертая зараженная консоль
23. Босс: Крабов МакГи
24. Побег капитана Кванта и битва с пиратами
25. Воздушный бой на Саргассо, третья аномалия
26. Планета Савали - Карта измерений, пятая зараженная консоль, четвертая аномалия
27. Планета Вицерон: тюрьма Зордум
28. Босс: Эскорт королевской гвардии
29. Скарсту - Поле обломков: Золотой кубок
30. Меганополис: Последняя битва

1. Все боты-шпионы и R.I.D.A. 8 - Супер-оружие
2. Все КрейггерБеарс

Противный Доктор Нефариус веселится от души. У него есть Габаритомер, который поврежден, но все еще в какой-то степени работает. Единственное, что его раздражает, - это то, что Рэтчет и Кланк обошли его головорезов. Теперь он хочет это изменить. Сидя в своем космическом корабле, он стреляет в вас толстым лазерным лучом. Избежать этого луча можно, дважды перепрыгнув через него. Для этого нужно хорошо рассчитать время. Если это не удается, прячьтесь за стенами. Они защитят Вас от его лазера (если он не атакует под определенным углом). Но они не защитят Вас от ракет, которые он время от времени выпускает.

Когда Нефариус выпускает свои ракеты, вы должны отойти от места, где вы стояли в тот момент, потому что именно туда (и в непосредственной близости) попадут снаряды.

Важно стрелять по космическому кораблю Нефариуса, когда у вас есть время. Лучшее место - зеленый купол. Если знать время прыжка через лазер, можно стрелять одновременно и значительно сократить время боя. Если у вас возникнут дополнительные трудности, ждите удобных моментов и оставайтесь в укрытии. С "Усилителем" у вас недостаточно дальнобойности. Победить противного доктора помогут стандартный бластер и бомба-бабочка. Бомбы-бабочки особенно эффективны, но их не хватит на весь бой. Через определенные промежутки времени перед вами появляются ящики с боеприпасами, но то, что в них находится, зависит от случайности. В дальних углах также есть исцеление, но, к сожалению, не очень сильное. Вам нужно не терять времени, метко стрелять и как можно быстрее закончить бой. В верхней части экрана вы увидите полоску, показывающую, сколько энергии осталось у Нефариуса.

Внимание, возможная ошибка: Нефариус время от времени отступает, чтобы загрузить свои ракеты. При возникновении ошибки Нефариус не покидает эту позицию. В него нельзя стрелять, так как он находится слишком далеко. В этом случае вам остается только зайти в меню паузы и начать прохождение секции заново. Вероятно, эта ошибка будет исправлена, но в текущей версии игры мы столкнулись с ней дважды.

Прыжок в другое измерение Сразу после схватки с Нефариусом злодей бросает себя и наших героев через пространственную складку. После нескольких прыжков подряд вы оказываетесь на пиратском корабле. Стреляйте по взрывоопасным бочкам, чтобы попасть в следующий портал.